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许多人都有「以小搏大」的观念，而且都很喜欢这个论调，毕竟可以满足自我挑战的梦想，刚好连锁加盟就具备这个特质，看着加盟店从一家、二家，逐步迈向百家、千家，这种成功的滋味非言语可以诉说。然而，理念不佳或是心存不良的加盟总部滥用这个观念时，许多问题就会接踵而至，最常遇到的问题包括：
1.总部管理能力欠佳许多加盟总部本身的营运即处于试验阶段，内部的组织、管理规章、管理制度皆尚未建立，甚至可能还有很多经营问题没有克服。总部能力尚且有待整顿，能够给予加盟者的辅导、建议及支援自然极其有限，加盟总部是新手，加盟者也是新手，两个新手合作的后果，自然增加了经营的风险性。
2.加盟总部管理松散对于生意不好的加盟总部要注意，但不要以为生意好的加盟总部就值得加入，一定要仔细研判。有些加盟总部的气度不够宽广，也没有宏观的视野，对于加盟店的商圈划分没有清楚界定，也没有严谨的管理约束，同一商圈，往往会出现好几个加盟店，而遇到加盟店不听从加盟总部指挥时，也不见加盟总部祭出违规罚则处理，这种松散的加盟管理，不仅会演变成自相残杀局面，还会让加盟者权益受损，彼此未能蒙其利，反而深受其害。
3.总部过度膨胀总部以为加盟店开店额越多，加盟金就会大幅提升，但因加盟店扩张计划尚未建立完备，导致后勤跟不上开店脚步，于是采购、配送、标准作业程序、研发、促销跟不上加盟店大幅增加的速度，导致问题滋生，穷于应付都来不及，哪有心情及时间建立完备制度。
4.总部财务不健全或不当运用财务杠杆评估一个企业财务是否健全的最佳时机，就是经济不景气的时候，有一些加盟总部的财务制度并未上轨道，景气好的时候足以应付，景气一旦看坏或是遇到市场冲击时，就很容易发生周转不灵的现象。另外有一些加盟总部的资金是很充裕，却因为不当财务的杠杆运用，或是多角化经营不当，而影响整体加盟体系的营运。
5.加盟门槛过低透过加盟连锁体系，可以满足自己当老板的梦想，但并不是每个人都适合当老板，但有些加盟总部根本不在乎加盟者的动机，只要能够付得起加盟金，不管条件如何，来者不拒，对于加盟动机及企图心、加盟者背景、店址选择等等全然漠视。
